Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG7P83436 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG7P83436 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG7P83436 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG7P83436 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms