Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms