Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERVK_113P63132 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms