Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HERVK_113P62684 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms