Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ERVS71-1P61550 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms