Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPS3AP61247 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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