Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK4P57078 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms