Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME5P56597 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NME5P56597 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms