Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD23AP54725 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms