Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC25A1P53007 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC25A1P53007 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC25A1P53007 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms