Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGDP52209 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGDP52209 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGDP52209 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGDP52209 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGDP52209 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGDP52209 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGDP52209 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms