Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRCA2P51587 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRCA2P51587 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms