Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ETV1P50549 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms