Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNBP48739 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms