Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCLMP48507 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCLMP48507 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCLMP48507 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms