Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ME1P48163 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ME1P48163 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
ME1P48163 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ME1P48163 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms