Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms