Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPOP42166 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms