Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACVR1BP36896 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms