Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA7P31268 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA7P31268 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms