Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
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