Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms