Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TNCP24821 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNCP24821 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNCP24821 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms