Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRZ1P23471 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms