Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MYF6P23409 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MYF6P23409 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MYF6P23409 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYF6P23409 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms