Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD247P20963 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD247P20963 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD247P20963 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms