Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB4AP20338 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB4AP20338 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB4AP20338 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB4AP20338 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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