Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB1P16220 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB1P16220 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB1P16220 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms