Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GLI4P10075 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GLI4P10075 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms