Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMIGD3P0DMS9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms