Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA5P08648 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA5P08648 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms