Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-9P01782 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms