Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAPBO95292 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAPBO95292 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VAPBO95292 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms