Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPHP4O75161 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPHP4O75161 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms