Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PDE6DO43924 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PDE6DO43924 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDE6DO43924 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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PDE6DO43924 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6DO43924 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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