Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PCH4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PCH4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PCH4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PCH4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PCH4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PCH4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PCH4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PCH4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PCH4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms