Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP17L12C9JPN9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms