Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
B4DXG7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B4DXG7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B4DXG7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms