Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SNX13Q9Y5W8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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