Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms