Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POMPQ9Y244 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms