Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM35Q9UPQ4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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