Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD4Q9ULV1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD4Q9ULV1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms