Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms