Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms