Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED13Q9UHV7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms