Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHORDC1Q9UHD1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms