Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms