Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms