Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms